ボトル型浄水器/カラフェ型浄水器でろ過した水にはミネラル分は含まれていますか？

はい。
水道水に含まれているカルシウムやマグネシウムなどのミネラル分は、ボトル型/カラフェ型浄水器用交換フィルター「マイクロディスクカートリッジ」を通過し、そのまま残ります。